Dockerイメージのビルド段階ではデータベースマイグレーションは実行しません。同期はコンテナ起動、アプリケーションプロセスの立ち上げ後に行われます。
ご注意ください。これらの提案は、私個人の使用上の好みと経験をまとめたものであり、あくまで参考としてご利用ください。